咖啡不像茶葉有官方命名的臺茶編號系統，臺灣栽培的咖啡品種大多沿用國際通行的名稱，源頭多半可以追溯回帝比卡與波旁這兩個最原始的品種。
兩大商用種：阿拉比卡與羅布斯塔
咖啡樹在生物學上有多個物種，但真正大規模商業栽培的只有兩種：阿拉比卡種（*Coffea arabica*）與羅布斯塔種 （*Coffea canephora*），臺灣的咖啡栽培以阿拉比卡種為主。兩者在產量占比、適合土壤與風味評價上差異明顯：
沒有臺灣官方命名的品種系統
先說明一個容易誤會的地方：茶葉有「臺茶」加編號的官方命名系統（例如臺茶18號紅玉），每個編號都經過農業 部茶及飲料作物改良場正式選育與命名。咖啡目前沒有對應的官方命名系統，臺灣栽培的咖啡品種名稱大多直接 沿用國際通行的名稱，是引種栽培，而非本地選育命名。
兩個最原始的品種：帝比卡與波旁
現今絕大多數阿拉比卡咖啡品種，追本溯源都可以連回兩個最古老的品種：帝比卡（Typica）與波旁（Bourbon）。 帝比卡最接近原始的野生種，公認能產出優質的咖啡風味，但產量偏低；波旁則是帝比卡的自然變異種，產量比 帝比卡高出兩到三成，但仍低於後來育成的多數現代品種。
早期的阿拉比卡品種選育重視產量與抗病性，近年風味品質也成為重要的考量因素，這也是精品咖啡市場興起後， 帝比卡與波旁這類老品種反而重新受到重視的原因——產量雖然不具優勢，卻保有難以取代的風味特質。
從帝比卡與波旁衍生出的常見品種
以下幾個品種在臺灣的咖啡園裡也看得到，大多是帝比卡或波旁的天然突變種或人工雜交種：
其他常見的品種還包括帕卡斯、帕卡瑪拉、威尼斯、維拉沙奇等，多數也是帝比卡或波旁系統下的變異種或雜交種， 各自在產量、耐病性、風味特徵上有不同的取捨。
記憶方法
兩大商用種口訣：阿拉比卡七成、羅布斯塔三成，阿拉比卡愛火山灰土、羅布斯塔愛腐植土，精品市場看阿拉比卡。
兩大原始品種口訣：帝比卡風味好但產量低，波旁是帝比卡的自然變異、產量高兩三成，後面的卡度拉、卡度愛、 肯特、紫葉、馬拉戈吉佩，幾乎都是這兩個老品種的變異或雜交後代。
品種與臺茶編號的差異提醒：咖啡沒有官方命名系統，看到的都是國際通行品種名稱，不是臺灣本地選育命名—— 跟茶葉的臺茶編號是兩回事，不要套用同一套邏輯去找「臺咖幾號」。